Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Actn1Q7TPR4 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms