Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms