Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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Rnf40Q3U319 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Rnf40Q3U319 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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