Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Shroom4Q1W617 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Shroom4Q1W617 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC6□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms