Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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