Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
VdrP48281 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
VdrP48281 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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VdrP48281 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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VdrP48281 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
VdrP48281 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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