Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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Rpl28P41105 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfm3-201ENSMUST00000051309 3928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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