Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
P10404 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
P10404 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
P10404 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
P10404 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms