Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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