Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Grik3B1AS29 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms