Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccdc47Q9D024 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms