Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Olfr1322-202ENSMUST00000217355 3886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ykt6Q9CQW1 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms