Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17467-201ENSMUST00000178553 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17412-201ENSMUST00000179261 468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17577-201ENSMUST00000179916 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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