Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Atg4aQ8C9S8 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Atg4aQ8C9S8 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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