Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
GcsamQ6RFH4 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm44294-201ENSMUST00000205090 728 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms