Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sft2d1Q5SSN7 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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