Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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