Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtprkP35822 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms