Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtpraP18052 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtpraP18052 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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