Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd4P10628 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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