Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Gm2056J3QQ02 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms