Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Brpf1B2RRD7 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Brpf1B2RRD7 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms