Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Limd1Q9QXD8 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms