Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Atg3Q9CPX6 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Atg3Q9CPX6 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms