Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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