Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PtprtQ99M80 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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PtprtQ99M80 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PtprtQ99M80 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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