Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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