Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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Rnf40Q3U319 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf40Q3U319 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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