Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ptchd1Q14B62 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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