Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Taf1bP97358 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms