Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Ifi203-ps-201ENSMUST00000155076 2556 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rpl28P41105 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Rpl28P41105 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Rpl28P41105 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rpl28P41105 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rpl28P41105 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Rpl28P41105 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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