Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PtprkP35822 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms