Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RxraP28700 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms