Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms