Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gtf3c6Q9D8P7 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms