Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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