Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Hdac9Q99N13 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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Hdac9Q99N13 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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Hdac9Q99N13 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Hdac9Q99N13 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hdac9Q99N13 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hdac9Q99N13 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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