Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr560-201ENSMUST00000210453 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Apobec3Q99J72 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Apobec3Q99J72 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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