Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Pdzrn3Q69ZS0 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Pdzrn3Q69ZS0 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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