Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm11645-201ENSMUST00000121589 649 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Sft2d1Q5SSN7 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms