Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms