Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PtprkP35822 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprkP35822 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms