Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PtprmP28828 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PtprmP28828 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PtprmP28828 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms