Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
RxraP28700 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Frmpd3-201ENSMUST00000044702 3141 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RxraP28700 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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