Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NefhP19246 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NefhP19246 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NefhP19246 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms