Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24919-201ENSMUST00000083020 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms