Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Grik3B1AS29 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms