Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Limd1Q9QXD8 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Limd1Q9QXD8 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Limd1Q9QXD8 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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