Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Ccdc47Q9D024 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm27952-201ENSMUST00000184748 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccdc47Q9D024 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms