Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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Pdzrn3Q69ZS0 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Pdzrn3Q69ZS0 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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